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Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin

Über die AG Schindelin

Forschung

Die Form folgt der Funktion”, dieser Leitsatz der Architektur des 20. Jahrhunderts fasst folgende Idee zusammen: Die Architektur eines Gebäudes sollte seine geplante Funktion widerspiegeln. In der Strukturbiologie gilt dieses Prinzip in umgekehrter Form, da die Kenntnis der dreidimensionalen Struktur eines biologischen Makromoleküls entscheidend für das Verständnis seiner Funktion ist, d.h. hier „Folgt die Funktion aus der Form“. Dieser Leitsatz motiviert unsere Forschungen in denen wir vor allem auf die Kristallstrukturanalyse zurückgreifen, eine Technik, die es erlaubt, die Struktur sowohl löslicher als auch membranständiger Proteine bei hoher Auflösung aufzuklären. Daneben kommen aber auch komplementäre biochemische, biophysikalische und zellbiologische Experimente zum Einsatz.

Struktur und Funktion von Proteinen

Zwei Themenkomplexe bilden die Kernpunkte unserer Untersuchungen:

(1) Protein Faltung und Reifung im endoplasmatischen Retikulum sowie der Abbau von Proteinen durch das Ubiquitin-Proteasom-System.

(2) Signalübertragung  in Nervenzellen mittels inhibitorischer Glyzin und GABA(A) Rezeptoren und deren Verankerung und Transport in postsynaptischen Zellen.

Weitere Informationen entnehmen Sie bitte der Homepage des Schindelin Labors.

Ausgewählte Publikationen

Misra M., Kuhn M., Löbel M., An H., Statsyuk A.V., Sotriffer C., Schindelin H. (2017). Dissecting the Specificity of Adenosyl Sulfamate Inhibitors Targeting the Ubiquitin-Activating Enzyme. Structure. 2017 Jul 5;25(7):1120-1129.e3. doi: 10.1016/j.str.2017.05.001. Epub 2017 Jun 1.


Kasaragod, V.B., Schindelin, H. (2016). Structural Framework for Metal Incorporation during Molybdenum Cofactor Biosynthesis. Structure. May 3;24(5):782-8. doi: 10.1016/j.str.2016.02.023. Epub Apr 21.


Hänzelmann, P.; Schindelin, H. (2016). Characterization of an Additional Binding Surface on the p97 N-Terminal Domain Involved in Bipartite Cofactor Interactions. Structure. 24(1): 140-7. doi: 10.1016/j.str.2015.10.026. Epub 2015 Dec 17.


Hänzelmann, P.; Schindelin, H. (2016). Structural Basis of ATP Hydrolysis and Intersubunit Signaling in the AAA+ ATPase p97. Structure. 24(1):127-39. doi: 10.1016/j.str.2015.10.026. Epub 2015 Dec 17.


Delto C.F., Heisler F.F., Kuper J., Sander B., Kneussel M., Schindelin H. (2015). The LisH motif of muskelin is crucial for oligomerization and governs intracellular localization. Structure. 2015 Feb 3;23(2):364-73. doi: 10.1016/j.str.2014.11.016. Epub 2015 Jan 8.


Maric H.M., Kasaragod V.B., Hausrat T.J., Kneussel M., Tretter V., Strømgaard K., Schindelin H. (2014). Molecular basis of the alternative recruitment of GABA(A) versus glycine receptors through gephyrin. Nat Commun. 2014 Dec 22;5:5767. doi: 10.1038/ncomms6767.


Maric H.M., Kasaragod V.B., Haugaard-Kedström L., Hausrat T.J., Kneussel M., Schindelin H., Strømgaard K. (2015). Design and synthesis of high-affinity dimeric inhibitors targeting the interactions between gephyrin and inhibitory neurotransmitter receptors. Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Jan 7;54(2):490-4. doi: 10.1002/anie.201409043. Epub 2014 Nov 20.


Soykan T., Schneeberger D., Tria G., Buechner C., Bader N., Svergun D., Tessmer I, Poulopoulos A, Papadopoulos T, Varoqueaux F, Schindelin H, Brose N. (2014). A conformational switch in collybistin determines the differentiation of inhibitory postsynapses. EMBO J. 2014 Sep 17;33(18):2113-33. doi: 10.15252/embj.201488143. Epub 2014 Jul 30.


Grimm C., Chari A., Pelz J.P., Kuper J., Kisker C., Diederichs K., Stark H., Schindelin H., Fischer U. (2013). Structural basis of assembly chaperone- mediated snRNP formation. Mol Cell. 2013 Feb 21;49(4):692-703. doi: 10.1016/j.molcel.2012.12.009. Epub 2013 Jan 17.


Maric H.M., Mukherjee J., Tretter V., Moss S.J., Schindelin H. (2011). Gephyrin-mediated γ-aminobutyric acid type A and glycine receptor clustering relies on a common binding site. J Biol Chem. 2011 Dec 9;286(49):42105-14. doi: 10.1074/jbc.M111.303412. Epub 2011 Oct 17.


Hänzelmann P., Schindelin H. (2011). The structural and functional basis of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM): mutually exclusive binding of cofactors to the N-terminal domain of p97. J Biol Chem. 2011 Nov 4;286(44):38679-90. doi: 10.1074/jbc.M111.274506. Epub 2011 Sep 13.


Hänzelmann P., Buchberger A., Schindelin H. (2011). Hierarchical binding of cofactors to the AAA ATPase p97. Structure. 2011 Jun 8;19(6):833-43. doi: 10.1016/j.str.2011.03.018.


Lee I., Schindelin H. (2008). Structural insights into E1-catalyzed ubiquitin activation and transfer to conjugating enzymes. Cell. 2008 Jul 25;134(2):268-78. doi: 10.1016/j.cell.2008.05.046.


Kim E.Y., Schrader N., Smolinsky B., Bedet C., Vannier C., Schwarz G., Schindelin H. Deciphering the structural framework of glycine receptor anchoring by gephyrin. EMBO J. 2006 Mar 22;25(6):1385-95. Epub 2006 Mar 2.


Tian G., Xiang S., Noiva R., Lennarz W.J., Schindelin H. (2006). The crystal structure of yeast protein disulfide isomerase suggests cooperativity between its active sites. Cell. 2006 Jan 13;124(1):61-73. Erratum in: Cell. 2006 Mar 10;124(5):1085-8.


Hänzelmann P., Schindelin H. (2004). Crystal structure of the S-adenosylmethionine-dependent enzyme MoaA and its implications for molybdenum cofactor deficiency in humans. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 31;101(35):12870-5. Epub 2004 Aug 18.


Lake M.W., Leimkühler S., Wuebbens M.M., Rajagopalan K.V., H. Schindelin. (2001). “The crystal structure of the MoeB-MoaD complex provides insights into the mechanism of ubiquitin activation”, Nature 414, 325-329.


Rudolph M.J., Wuebbens M.M., Rajagopalan K.V., Schindelin H. (2001). Crystal structure of molybdopterin synthase and its evolutionary relationship to ubiquitin-activation. Nature Struct. Biol. 8, 42-46.

Team

Nicole Bader

Technische/r Assistent/in
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.018

Teresa Frank

Mitarbeiter/in Verwaltung - Sekretariat
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.040

Carolina Galgenmüller

Doktorand/in
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.018

Dr. Petra Hänzelmann

Postdoc
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.020

Nasir Imam

Doktorand/in
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.017

Dr. Vikram Kasaragod

Postdoc
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.017

Monika Kuhn

Technische/r Assistent/in
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.022

Anabel Pacios Michelena

Doktorand/in
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.021

Aparna Pottikkadavath

Doktorandin
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.021

Prof. Dr. Hermann Schindelin

Gruppenleiter
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str.2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.023

Andrea Schott-Heinzmann

Sekretariat
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.016

Dr. Andrea Thorn

Postdoc
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.042

Ngoc Truongvan

Doktorand
Rudolf-Virchow-Zentrum für Experimentelle Biomedizin
Universität Würzburg
Josef-Schneider-Str. 2
97080 Würzburg
Deutschland
Gebäude:Haus D15
Raum:00.017
Curriculum Vitae

Current position

Professor of Structural Biology and Biochemistry at the Rudolf Virchow Center of  University of Würzburg (since 2006)

Research Experience

2002-2006   Associate Professor, Stony Brook University, USA
1998-2002   Assistant Professor, Stony Brook University, USA
1994-1998   Postdoc, California Institute of Technology, Pasadena, CA, USA

Education

1991-1994    Dr. rer. nat (PhD) Biochemistry and Structural Biology, Freie Universität Berlin, Germany

Awards and Fellowships

  • Graduate Fellowship Deutsche Forschungsgemeinschaft (1991-1994)
  • Postdoctoral Fellowship from the Deutsche Forschungsgemeinschaft (1995-1997)
  • Postdoctoral Fellowship from the Howard Hughes Medical Institute (1997-1998)
  • Targeted Research Opportunity Award, Stony Brook University (2001-2003)

Selected professional activities

  • Member of Participating Research Team of Beam Line X26C at the National Synchrotron Light Source at Brookhaven National Laboratory (1998-2006)
  • Spokesperson for the Participating Research Team of Beam Line X26C at the National Synchrotron Light Source at Brookhaven National Laboratory (2004-2006)
  • Member of the Admissions Committee for the Graduate Program in Molecular and Cellular Biology (2000-2001)
  • Director of Admissions for Graduate Program in Biochemistry and Structural Biology (2000-2006) 
  • Member of the Molecular and Cellular Biology Graduate Program Executive Committee (2000-2006)
  • Speaker of the section Molecular Biosciences within the Graduate School of Life Sciences at the Uni Würzburg (since 2014)
  • Speaker Interest Group 1 “Biological Crstallography” of the German Society for Crystallography (since 2014)
  • Coopted member of the “Committee on Research with Synchrotron Radiation” (since 2015)
  • Member of the Editorial Board of the Journal of Biological Chemistry (since 2015)
Lehre

Position

Professor für Biochemie/Strukturbiologie - Rudolf-Virchow-Zentrum
Mitglied - Graduate School of Life Sciences
Supervisor und Mitglied in verschiedenen Promotionskomitees - Graduate School of Life Sciences/Biomedizin 

Lehrveranstaltungen

  • Struktur und Funktion biologischer Makromolekuele (für Bachelorstudenten)
  • Makromolekulare Kristallographie (fuer Masterstudenten)
  • Literaturseminar Ubiquitin- Proteasom- System (für Masterstudenten udn Doktoranden)
  • Literaturseminar Inonenkanäle und assoziierte Proteine (für Masterstudenten und Doktoranden)
  • Studenbegleitende Mitarbeiten im Forschungslabor (für Bachelor- und Masterstudenen)

Weiter Infos zu den Lehrveranstaltungen finden Sie hier.  

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