Prof. Dr. A. Westermann
FORSCHUNGSPROJEKTE
- RNA-Biologie von anaeroben
Darmkommensalen
- Wirt-Mikroben-Interaktionsstudien
- Artenübergreifende RNA-seq-Technologien
- Hypoxische Gewebemodelle zur
bakteriellen Kolonisation
MODEL ORGANISMS
Forschung
Der menschliche Darmtrakt bietet eine attraktive Umgebung für nützliche, aber auch für krankheitserregende Bakterien. Die nützlichen Bakterien helfen dabei, Nahrung zu verdauen, und bieten darüber hinaus zahlreiche gesundheitliche Vorteile. Krankheitserreger hingegen nutzen den Darm als Angriffspunkt für eine Infektion. Beide Gruppen beeinflussen sowohl sich gegenseitig, als auch ihren gemeinsamen Wirt, uns Menschen. Das Verständnis der diesen Wechselwirkungen zugrunde liegenden regulatorischen Prozesse kann zur Bekämpfung von Infektionskrankheiten beitragen. Während wir jedoch zunehmend Einblicke in proteinvermittelte Prozesse bekommen, ist die Rolle von RNA-zentrierten Mechanismen in der Kontrolle mikrobieller Interaktionen im Darm noch weitestgehend unerforscht.
Kooshapour H, Matera G, Venturini E, Metka L, Bischler T, Vogel J, Westermann AJ (2025)
Intramacrophage RIL-seq uncovers an RNA antagonist of the Salmonella virulence-associated small RNA PinT.
Nucleic Acids Research 53(22):gkaf1364. doi: 10.1093/nar/gkaf1364.
Bornet E, Prezza G, Cecchino L, Jenniches L, Behrends J, Tawk C, Huang KC, Strowig T, Vogel J, Barquist L, Saliba A-E, Westermann AJ (2025)
Low-input RNA-seq suggests metabolic specialization underlying morphological heterogeneity in a gut commensal bacterium.
Cell Reports 44(6):115844. doi: 10.1016/j.celrep.2025.115844.
Spotlight in Trends in Microbiology (PMID: 40628542).
Rüttiger A-S, Ryan D, Spiga L, Lamm-Schmidt V, Prezza G, Reichardt S, Langford M, Barquist L, Faber F, Zhu W, Westermann AJ (2025)
The global RNA-binding protein RbpB is a regulator of polysaccharide utilization in Bacteroides thetaiotaomicron.
Nature Communications 16(1):208. doi: 10.1038/s41467-024-55383-8.
Prezza G, Liao C, Reichardt S, Beisel CL, Westermann AJ (2024)
CRISPR-based screening of small RNA modulators of bile susceptibility in Bacteroides thetaiotaomicron.
PNAS 121(6):e2311323121. doi: 10.1073/pnas.2311323121.
Ryan D, Bornet E, Prezza G, Varshini Alampalli S, Franco de Carvalho T, Felchle H, Ebbecke T, Hayward R, Deutschbauer AM, Barquist L, Westermann AJ (2024)
An expanded transcriptome atlas for Bacteroides thetaiotaomicron reveals a small RNA that modulates tetracycline sensitivity.
Nature Microbiology 9(4):1130-1144. doi: 10.1038/s41564-024-01642-9.
Prof. Alexander Westermann
Dr. Lena Amend
Orla Connell
Taís Franco de Carvalho
Dr. Thomas Guest
Dr. Takeshi Kanda
Nahyung Ko
Hoda Kooshapour
Lisa Pfeuffer
