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    IMIB - INSTITUT FÜR MOLEKULARE INFEKTIONSBIOLOGIE

    Prof. Dr. Cynthia Sharma

     

             FORSCHUNGSPROJEKTE

    • RNA-basierte Regulation in bakteriellen Krankheitserregern
       
    • Identifizierung und Charakterisierung von kleinen Proteinen in Bakterien
       
    • Mechanismen und Funktionen von prokaryotischen CRISPR-Cas-Systemen

    Modellorganismen

    Forschung

    In unserer Arbeitsgruppe erforschen wir die Mechanismen und Funktionen der Genregulation des Magenkeims Helicobacter pylori und des verwandten Lebensmittelkeims Campylobacter jejuni. Insbesondere fokussieren wir uns auf die posttranskriptionelle Regulation der Stressantwort und Virulenzkontrolle durch kleine regulatorische RNAs (sRNAs) und assoziierte RNA-bindende Proteine (RBPs). Wir entwickeln und verwenden verschiedene Hochdurchsatzsequenzierungs-ansätze für globale Transkriptomstudien und die Analyse von RNA-Protein-Komplexen sowie Translatomanalysen zur Identifizierung kleiner Proteine. Mittels dreidimensionaler (3D) Infektionsmodelle, die auf der Technologie der Gewebezüchtung basieren, untersuchen wir die Rolle von sRNAs, kleinen Proteinen und RBPs bei der Pathogenese dieser weit verbreiteten menschlichen Krankheitserreger.

    Jiao C, Sharma S, Dugar G, Peeck NL, Bischler T, Wimmer F, Yu Y, Barquist L, Schoen C, Kurzai C, Sharma CM*, Beisel CL* (2021) * Corresponding authors
    Non-canonical crRNAs derived from host transcripts enable multiplexable RNA detection by Cas9
    Science 372(6545):941-948

    Pernitzsch SR, Alzheimer M, Bremer BU, Robbe-Saule M, de Reuse H, Sharma CM (2021)
    Small RNA mediated gradual control of lipopolysaccharide biosynthesis control affects antibiotic resistance in Helicobacter pylori
    Nature Communications 12(1):4433

    Eisenbart SK, Alzheimer M, Pernitzsch SR, Dietrich S, Stahl S, Sharma CM (2020)
    A repeat-associated small RNA controls the major virulence factors of Helicobacter pylori
    Molecular Cell 80(2):210-226

    Alzheimer M, Svensson SL, König F, Schweinlin M, Metzger M, Walles H, Sharma CM (2020)
    A three-dimensional intestinal tissue model reveals factors and small regulatory RNAs important for colonization with Campylobacter jejuni
    PLoS Pathogens 16(2):e1008304

    Dugar G, Leenay RT, Eisenbart SK, Bischler T, Aul BU, Beisel CL, Sharma CM (2018)
    CRISPR RNA-Dependent Binding and Cleavage of Endogenous RNAs by the Campylobacter jejuni Cas9
    Molecular Cell 69(5):893-905

    Publikationen chronologisch (pdf)

    Prof. Dr. Cynthia Sharma

    Leitung Lehrstuhl Molekulare Infektionsbiologie II
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.019
    Telefon: +49 931 31-82560

    Dr. Mona Alzheimer

    Scientific Coordinator
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.015
    Telefon: +49 931 31-89819

    Belinda Bremer

    Technische/r Assistent/in
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.241
    Telefon: +49 931 31-80150

    Thea Bruchhardt

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-81911

    Dr. Elisabetta Fiore

    Postdoc
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.021
    Telefon: +49 931 31-81832

    Kathrin Froschauer

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.021
    Telefon: +49 931 31-84627

    Christine Hambrecht-Schleyer

    Technische/r Assistent/in
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.241
    Telefon: +49 931 31-82132

    Philipp Kible

    Technische/r Assistent/in
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.241
    Telefon: +49 931 31-88718

    Dr. Salini Konikkat

    Postdoc
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-89481

    Johannes Kullmann

    Doktorand
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-83262

    Fabian König

    Doktorand
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.015
    Telefon: +49 931 31-83880

    Manasa Narayan

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-87900

    Dr. Thomas Prossliner

    Postdoc
    Institut für Molekulare Infektionsbiolgie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.021
    Telefon: +49 931 31-85822

    Dr. Sahil Sharma

    Postdoc
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-89580

    Dr. Annamaria Zannoni

    Postdoc
    Insitut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.017
    Telefon: +49 931 31-89667

    Sarah Zentgraf

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Sharma
    Gebäude: D15
    Raum: 01.021
    Telefon: +49 931 31-82953