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IMIB - INSTITUT FÜR MOLEKULARE INFEKTIONSBIOLOGIE

Prof. Dr. Jörg Vogel - RNA Biologie

Modellorganismen

Forschung

Nichtcodierende RNAs spielen in allen Bereichen des Lebens eine wichtige regulatorische Rolle. Die Vogelgruppe will die Rolle von ncRNAs und RNA-bindenden Proteinen (RBPs) im Zusammenhang mit bakteriellen Infektionen verstehen, mit dem Ziel, dieses Wissen für eine gezielte Manipulation der menschlichen Mikrobiota zu nutzen. Die derzeitigen vier Hauptforschungsbereiche des Vogel-Labors sind: i) Entdeckung neuartiger funktioneller RNAs in Mikroben, einschließlich der Arbeit an dem krebsassoziierten Bakterium Fusobacterium nucleatum; ii) Charakterisierung von und Screening nach bakteriellen RNA-bindenden Proteinen; iii) neue RNA-seq-Methoden für die Infektionsbiologie, einschließlich Einzelzell-RNA-seq von eukaryotischen und bakteriellen Zellen; iv) Antibiotika auf der Basis von Antisense-Oligonukleotiden (ASO) für die präzise Bearbeitung des menschlichen Mikrobioms und komplexer mikrobieller Gemeinschaften.

Ponath F, Tawk C, Zhu Y, Barquist L, Faber F, Vogel J (2021)
RNA landscape of the emerging cancer-associated microbe Fusobacterium nucleatum
Nature Microbiology 6(8):1007-1020

Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2016)
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
Nature 529:496-501

Papenfort K, Sun Y, Miyakoshi M, Vanderpool CK, Vogel J (2013)
Small RNA-mediated activation of sugar phosphatase mRNA regulates glucose homeostasis
Cell 153:426–437

Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (2011)
CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III
Nature 471(7340):602-7

Sharma CM, Hoffmann S, Darfeuille F, Reignier J, Findeiß S, Sittka A, Chabas S, Reiche K, Hackermüller J,
Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2010)
The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori
Nature 464(7285)250-255

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Publications sorted (pdf)

 

Prof. Dr. Jörg Vogel

Institutsleiter
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Raum: 01.022
Telefon: +49 931 31-82576

Leandro Buhlmann

Doktorand
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Raum: 01.025
Telefon: +49 931 31-84789

Valentina Cosi

Doktorandin
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Telefon: +49 931 31-83301

Thao Do

Scientist
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Telefon: +49 931 31-85730

Dr. Suyen Espinoza Miranda

Postdoc
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Raum: 01.021
Telefon: +49 931 31-88086

Dr. Milan Gerovac

Postdoc
AG Vogel
Raum: 01.029
Telefon: +49-931-31-88139

Dr. Chandradhish Ghosh

Postdoc
AG Vogel
Raum: 01.020
Telefon: +49 931 31-83762

Dr. Esther Hauschild

Technische/r Assistent/in
AG Vogel
Raum: 01.203
Telefon: +49-931-31-87292

Jakob Jung

Doktorand
AG Vogel
Raum: 01.051
Telefon: +49 931 31-87151
Link: PhD Project

Dr. Tobias Kerrinnes

Postdoc
AG Vogel
Raum: 01.025
Telefon: +49 931 31-83639

Sarah Nentwich

Doktorandin
Institut für Molekulare Infektionbiologie
AG Vogel
Raum: 01.025
Telefon: +49 931 31-86287

Sandra Pérez Jiménez

PhD
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Raum: 01.020
Telefon: +49 931 31-84754

Lisa Pfeuffer

Technische/r Assistent/in
AG Vogel
Raum: 01.203
Telefon: +49 931 31-87881

Barbara Plaschke

Technische/r Assistent/in
AG Vogel
Raum: 01.203
Telefon: +49-931-31-80431

Falk Ponath

Doktorand
AG Vogel
Raum: 01.026
Telefon: +49-931-31-83902

Dr. Linda Popella

Postdoc
AG Vogel
Raum: 01.020
Telefon: +49 931 31-87481

Dr. Paramita Sarkar

Postdoc
AG Vogel
Telefon: +49 931 31-84992

Dr. Toby Wilkinson

Postdoc
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Telefon: +49 931 31-81869

Yan Zhu

Doktorandin
AG Vogel
Raum: 01.026
Telefon: +49-931-31-99914

Anna Zweyer

Technische/r Assistent/in
Institut für Molekulare Infektionsbiologie
AG Vogel
Telefon: +49 931 31-84047