Prof. Dr. Jörg Vogel - RNA Biologie
Modellorganismen
Forschung
Nichtcodierende RNAs spielen in allen Bereichen des Lebens eine wichtige regulatorische Rolle. Die Vogelgruppe will die Rolle von ncRNAs und RNA-bindenden Proteinen (RBPs) im Zusammenhang mit bakteriellen Infektionen verstehen, mit dem Ziel, dieses Wissen für eine gezielte Manipulation der menschlichen Mikrobiota zu nutzen. Die derzeitigen vier Hauptforschungsbereiche des Vogel-Labors sind: i) Entdeckung neuartiger funktioneller RNAs in Mikroben, einschließlich der Arbeit an dem krebsassoziierten Bakterium Fusobacterium nucleatum; ii) Charakterisierung von und Screening nach bakteriellen RNA-bindenden Proteinen; iii) neue RNA-seq-Methoden für die Infektionsbiologie, einschließlich Einzelzell-RNA-seq von eukaryotischen und bakteriellen Zellen; iv) Antibiotika auf der Basis von Antisense-Oligonukleotiden (ASO) für die präzise Bearbeitung des menschlichen Mikrobioms und komplexer mikrobieller Gemeinschaften.
Ponath F, Tawk C, Zhu Y, Barquist L, Faber F, Vogel J (2021)
RNA landscape of the emerging cancer-associated microbe Fusobacterium nucleatum
Nature Microbiology 6(8):1007-1020
Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2016)
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
Nature 529:496-501
Papenfort K, Sun Y, Miyakoshi M, Vanderpool CK, Vogel J (2013)
Small RNA-mediated activation of sugar phosphatase mRNA regulates glucose homeostasis
Cell 153:426–437
Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (2011)
CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III
Nature 471(7340):602-7
Sharma CM, Hoffmann S, Darfeuille F, Reignier J, Findeiß S, Sittka A, Chabas S, Reiche K, Hackermüller J,
Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2010)
The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori
Nature 464(7285)250-255
Publications chronological (pdf)
Prof. Dr. Jörg Vogel
Leandro Buhlmann
Valentina Cosi
Thao Do
Dr. Milan Gerovac
Dr. Esther Hauschild
Jakob Jung
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Lisa Pfeuffer
Sushila Pisano
Falk Ponath
Dr. Linda Popella
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Laura Vogel
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Yan Zhu
