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    IMIB - INSTITUT FÜR MOLEKULARE INFEKTIONSBIOLOGIE

    Prof. Dr. Jörg Vogel - RNA Biologie

    Modellorganismen

    Forschung

    Nichtcodierende RNAs spielen in allen Bereichen des Lebens eine wichtige regulatorische Rolle. Die Vogelgruppe will die Rolle von ncRNAs und RNA-bindenden Proteinen (RBPs) im Zusammenhang mit bakteriellen Infektionen verstehen, mit dem Ziel, dieses Wissen für eine gezielte Manipulation der menschlichen Mikrobiota zu nutzen. Die derzeitigen vier Hauptforschungsbereiche des Vogel-Labors sind: i) Entdeckung neuartiger funktioneller RNAs in Mikroben, einschließlich der Arbeit an dem krebsassoziierten Bakterium Fusobacterium nucleatum; ii) Charakterisierung von und Screening nach bakteriellen RNA-bindenden Proteinen; iii) neue RNA-seq-Methoden für die Infektionsbiologie, einschließlich Einzelzell-RNA-seq von eukaryotischen und bakteriellen Zellen; iv) Antibiotika auf der Basis von Antisense-Oligonukleotiden (ASO) für die präzise Bearbeitung des menschlichen Mikrobioms und komplexer mikrobieller Gemeinschaften.

    Ponath F, Tawk C, Zhu Y, Barquist L, Faber F, Vogel J (2021)
    RNA landscape of the emerging cancer-associated microbe Fusobacterium nucleatum
    Nature Microbiology 6(8):1007-1020

    Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2016)
    Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
    Nature 529:496-501

    Papenfort K, Sun Y, Miyakoshi M, Vanderpool CK, Vogel J (2013)
    Small RNA-mediated activation of sugar phosphatase mRNA regulates glucose homeostasis
    Cell 153:426–437

    Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (2011)
    CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III
    Nature 471(7340):602-7

    Sharma CM, Hoffmann S, Darfeuille F, Reignier J, Findeiß S, Sittka A, Chabas S, Reiche K, Hackermüller J,
    Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2010)
    The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori
    Nature 464(7285)250-255

    Publications chronological (pdf)

    Publications sorted (pdf)

     

    Prof. Dr. Jörg Vogel

    Institutsleiter
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Raum: 01.022
    Telefon: +49 931 31-82576

    Leandro Buhlmann

    Doktorand
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Raum: 01.025
    Telefon: +49 931 31-84789

    Samuel Carien

    Doktorand
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Raum: 01.020
    Telefon: +49 931 31-82709

    Valentina Cosi

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Telefon: +49 931 31-83301

    Thao Do

    Scientist
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Telefon: +49 931 31-85730

    Dr. Milan Gerovac

    Postdoc
    AG Vogel
    Raum: 01.029
    Telefon: +49-931-31-88139

    Dr. Chandradhish Ghosh

    Postdoc
    AG Vogel
    Raum: 01.020
    Telefon: +49 931 31-83762

    Dr. Esther Hauschild

    Technische/r Assistent/in
    AG Vogel
    Raum: 01.203
    Telefon: +49-931-31-87292

    Christina Homberger

    Doktorandin
    AG Vogel
    Raum: 01.021
    Telefon: +49-931-31-81059

    Jakob Jung

    Doktorand
    AG Vogel
    Raum: 01.051
    Telefon: +49 931 31-87151

    Dr. Tobias Kerrinnes

    Postdoc
    AG Vogel
    Raum: 01.025
    Telefon: +49 931 31-83639

    Sarah Nentwich

    Doktorandin
    Institut für Molekulare Infektionbiologie
    AG Vogel
    Raum: 01.025
    Telefon: +49 931 31-86287

    Anna Nöhren

    Technische/r Assistent/in
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Telefon: +49 931 31-84047

    Lisa Pfeuffer

    Technische/r Assistent/in
    AG Vogel
    Raum: 01.203
    Telefon: +49 931 31-87881

    Barbara Plaschke

    Technische/r Assistent/in
    AG Vogel
    Raum: 01.203
    Telefon: +49-931-31-80431

    Falk Ponath

    Doktorand
    AG Vogel
    Raum: 01.026
    Telefon: +49-931-31-83902

    Dr. Linda Popella

    Postdoc
    AG Vogel
    Raum: 01.020
    Telefon: +49 931 31-87481

    Dr. Paramita Sarkar

    Postdoc
    AG Vogel
    Telefon: +49 931 31-84992

    Laura Vogel

    Technische/r Assistent/in
    AG Vogel
    Raum: 01.201
    Telefon: +49 931 31-84517

    Dr. Toby Wilkinson

    Postdoc
    Institut für Molekulare Infektionsbiologie
    AG Vogel
    Telefon: +49 931 31-81869

    Yan Zhu

    Doktorandin
    AG Vogel
    Raum: 01.026
    Telefon: +49-931-31-99914