Prof. Dr. Jörg Vogel - RNA Biologie
Modellorganismen
Forschung
Nichtcodierende RNAs spielen in allen Bereichen des Lebens eine wichtige regulatorische Rolle. Die Vogelgruppe will die Rolle von ncRNAs und RNA-bindenden Proteinen (RBPs) im Zusammenhang mit bakteriellen Infektionen verstehen, mit dem Ziel, dieses Wissen für eine gezielte Manipulation der menschlichen Mikrobiota zu nutzen. Die derzeitigen vier Hauptforschungsbereiche des Vogel-Labors sind: i) Entdeckung neuartiger funktioneller RNAs in Mikroben, einschließlich der Arbeit an dem krebsassoziierten Bakterium Fusobacterium nucleatum; ii) Charakterisierung von und Screening nach bakteriellen RNA-bindenden Proteinen; iii) neue RNA-seq-Methoden für die Infektionsbiologie, einschließlich Einzelzell-RNA-seq von eukaryotischen und bakteriellen Zellen; iv) Antibiotika auf der Basis von Antisense-Oligonukleotiden (ASO) für die präzise Bearbeitung des menschlichen Mikrobioms und komplexer mikrobieller Gemeinschaften.
Ponath F, Tawk C, Zhu Y, Barquist L, Faber F, Vogel J (2021)
RNA landscape of the emerging cancer-associated microbe Fusobacterium nucleatum
Nature Microbiology 6(8):1007-1020
Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2016)
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
Nature 529:496-501
Papenfort K, Sun Y, Miyakoshi M, Vanderpool CK, Vogel J (2013)
Small RNA-mediated activation of sugar phosphatase mRNA regulates glucose homeostasis
Cell 153:426–437
Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (2011)
CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III
Nature 471(7340):602-7
Sharma CM, Hoffmann S, Darfeuille F, Reignier J, Findeiß S, Sittka A, Chabas S, Reiche K, Hackermüller J,
Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J (2010)
The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori
Nature 464(7285)250-255
Publications chronological (pdf)
Prof. Dr. Jörg Vogel
Leandro Buhlmann
Valentina Cosi
Thao Do
Dr. Suyen Espinoza Miranda
Dr. Milan Gerovac
Dr. Esther Hauschild
Jakob Jung
Sarah Nentwich
Sandra Pérez Jiménez
Lisa Pfeuffer
Falk Ponath
Dr. Linda Popella
Dr. Paramita Sarkar
Dr. Toby Wilkinson
Yan Zhu
Anna Zweyer
